MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
2	NC_015915	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	343127119
3	NC_015915	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127119
4	NC_015915	ATT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127119
5	NC_015915	ACA	3	9	370	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
6	NC_015915	TACAAA	2	12	385	396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	343127119
7	NC_015915	AT	3	6	397	402	50 %	50 %	0 %	0 %	343127119
8	NC_015915	T	8	8	1174	1181	0 %	100 %	0 %	0 %	343127120
9	NC_015915	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
10	NC_015915	ATC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
11	NC_015915	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127120
12	NC_015915	A	7	7	1305	1311	100 %	0 %	0 %	0 %	343127120
13	NC_015915	CAT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
14	NC_015915	ACTTT	2	10	1373	1382	20 %	60 %	0 %	20 %	343127120
15	NC_015915	T	7	7	1416	1422	0 %	100 %	0 %	0 %	343127120
16	NC_015915	A	9	9	1434	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	343127120
17	NC_015915	CAT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
18	NC_015915	AT	3	6	1609	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	343127120
19	NC_015915	T	6	6	2343	2348	0 %	100 %	0 %	0 %	343127121
20	NC_015915	A	6	6	2358	2363	100 %	0 %	0 %	0 %	343127121
21	NC_015915	A	6	6	2431	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	343127121
22	NC_015915	A	7	7	2453	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	343127121
23	NC_015915	AT	3	6	3864	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	343127122
24	NC_015915	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	343127122
25	NC_015915	AAAC	2	8	3936	3943	75 %	0 %	0 %	25 %	343127122
26	NC_015915	TTA	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127122
27	NC_015915	CAA	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127122
28	NC_015915	TAAA	2	8	4121	4128	75 %	25 %	0 %	0 %	343127122
29	NC_015915	A	6	6	4126	4131	100 %	0 %	0 %	0 %	343127122
30	NC_015915	TTAA	2	8	4391	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	343127123
31	NC_015915	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	343127123
32	NC_015915	AAAT	2	8	4482	4489	75 %	25 %	0 %	0 %	343127123
33	NC_015915	A	6	6	4494	4499	100 %	0 %	0 %	0 %	343127123
34	NC_015915	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127123
35	NC_015915	TAGC	2	8	4678	4685	25 %	25 %	25 %	25 %	343127124
36	NC_015915	GAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
37	NC_015915	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127124
38	NC_015915	T	6	6	4722	4727	0 %	100 %	0 %	0 %	343127124
39	NC_015915	AT	3	6	4733	4738	50 %	50 %	0 %	0 %	343127124
40	NC_015915	AGA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
41	NC_015915	TCT	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127124
42	NC_015915	T	8	8	4811	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	343127124
43	NC_015915	ATG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127124
44	NC_015915	A	6	6	4832	4837	100 %	0 %	0 %	0 %	343127124
45	NC_015915	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	343127124
46	NC_015915	TAA	2	6	4858	4863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127124
47	NC_015915	GTG	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127124
48	NC_015915	GGA	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127124
49	NC_015915	TAAAT	2	10	5506	5515	60 %	40 %	0 %	0 %	343127125
50	NC_015915	ATT	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127125
51	NC_015915	CAAA	2	8	5592	5599	75 %	0 %	0 %	25 %	343127125
52	NC_015915	CAC	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127125
53	NC_015915	A	8	8	5629	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
54	NC_015915	A	7	7	5665	5671	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
55	NC_015915	CAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
56	NC_015915	A	6	6	5716	5721	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
57	NC_015915	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
58	NC_015915	TCAAA	2	10	5774	5783	60 %	20 %	0 %	20 %	343127125
59	NC_015915	A	6	6	5817	5822	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
60	NC_015915	ATA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127125
61	NC_015915	GAT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127125
62	NC_015915	A	6	6	5943	5948	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
63	NC_015915	A	8	8	5956	5963	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
64	NC_015915	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
65	NC_015915	AGA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
66	NC_015915	AT	3	6	6132	6137	50 %	50 %	0 %	0 %	343127125
67	NC_015915	A	8	8	6152	6159	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
68	NC_015915	GAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
69	NC_015915	TAC	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
70	NC_015915	A	6	6	6177	6182	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
71	NC_015915	A	8	8	6269	6276	100 %	0 %	0 %	0 %	343127125
72	NC_015915	CTA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
73	NC_015915	A	7	7	7154	7160	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
74	NC_015915	TGT	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127126
75	NC_015915	TAT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
76	NC_015915	AAAG	2	8	7244	7251	75 %	0 %	25 %	0 %	343127126
77	NC_015915	A	6	6	7261	7266	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
78	NC_015915	AGA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
79	NC_015915	AG	3	6	7334	7339	50 %	0 %	50 %	0 %	343127126
80	NC_015915	AGAAAT	2	12	7423	7434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127126
81	NC_015915	AGA	3	9	7438	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
82	NC_015915	TGA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
83	NC_015915	TGA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
84	NC_015915	TAT	2	6	7601	7606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
85	NC_015915	AAAT	2	8	7624	7631	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
86	NC_015915	AAT	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
87	NC_015915	A	7	7	7660	7666	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
88	NC_015915	ATA	3	9	7674	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
89	NC_015915	AAT	2	6	7721	7726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
90	NC_015915	TAAA	2	8	7728	7735	75 %	25 %	0 %	0 %	343127126
91	NC_015915	A	7	7	7733	7739	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
92	NC_015915	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
93	NC_015915	AATTA	2	10	7762	7771	60 %	40 %	0 %	0 %	343127126
94	NC_015915	T	6	6	7808	7813	0 %	100 %	0 %	0 %	343127126
95	NC_015915	A	6	6	7824	7829	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
96	NC_015915	AAG	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
97	NC_015915	A	6	6	7858	7863	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
98	NC_015915	A	9	9	7885	7893	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
99	NC_015915	A	6	6	7909	7914	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
100	NC_015915	CTT	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127126
101	NC_015915	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
102	NC_015915	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
103	NC_015915	A	7	7	8053	8059	100 %	0 %	0 %	0 %	343127126
104	NC_015915	TAT	2	6	8770	8775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127127
105	NC_015915	TCC	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127127
106	NC_015915	T	7	7	8817	8823	0 %	100 %	0 %	0 %	343127127
107	NC_015915	AAC	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127127
108	NC_015915	CTT	2	6	8868	8873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127127
109	NC_015915	T	7	7	8882	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	343127127
110	NC_015915	TAG	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127127
111	NC_015915	CT	3	6	8920	8925	0 %	50 %	0 %	50 %	343127127
112	NC_015915	CAAA	2	8	8931	8938	75 %	0 %	0 %	25 %	343127127
113	NC_015915	AAAAAT	2	12	9566	9577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343127128
114	NC_015915	A	6	6	9593	9598	100 %	0 %	0 %	0 %	343127128
115	NC_015915	GC	3	6	9632	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	343127128
116	NC_015915	AAG	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127128
117	NC_015915	ACTTT	2	10	9929	9938	20 %	60 %	0 %	20 %	343127129
118	NC_015915	TA	3	6	9945	9950	50 %	50 %	0 %	0 %	343127129
119	NC_015915	C	8	8	10012	10019	0 %	0 %	0 %	100 %	343127129
120	NC_015915	TGTA	2	8	10296	10303	25 %	50 %	25 %	0 %	343127130
121	NC_015915	T	7	7	10324	10330	0 %	100 %	0 %	0 %	343127130
122	NC_015915	ATAA	2	8	10364	10371	75 %	25 %	0 %	0 %	343127130
123	NC_015915	CTT	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127130
124	NC_015915	ACA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127130
125	NC_015915	A	7	7	10445	10451	100 %	0 %	0 %	0 %	343127130
126	NC_015915	AAT	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127130
127	NC_015915	T	6	6	10646	10651	0 %	100 %	0 %	0 %	343127131
128	NC_015915	AAAAT	2	10	10666	10675	80 %	20 %	0 %	0 %	343127131
129	NC_015915	TCA	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127131
130	NC_015915	T	7	7	10700	10706	0 %	100 %	0 %	0 %	343127131
131	NC_015915	TC	3	6	10734	10739	0 %	50 %	0 %	50 %	343127131
132	NC_015915	T	6	6	10743	10748	0 %	100 %	0 %	0 %	343127131
133	NC_015915	AAAC	2	8	10754	10761	75 %	0 %	0 %	25 %	343127131
134	NC_015915	T	7	7	11090	11096	0 %	100 %	0 %	0 %	343127132
135	NC_015915	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127132
136	NC_015915	ATA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
137	NC_015915	ATA	2	6	11146	11151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
138	NC_015915	TAT	2	6	11154	11159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127132
139	NC_015915	CTA	3	9	11172	11180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127132
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405	NC_015915	T	7	7	26339	26345	0 %	100 %	0 %	0 %	343127151
406	NC_015915	A	6	6	26406	26411	100 %	0 %	0 %	0 %	343127151
407	NC_015915	TAA	2	6	26425	26430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127151
408	NC_015915	AAT	2	6	26461	26466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127151
409	NC_015915	TTGA	2	8	26480	26487	25 %	50 %	25 %	0 %	343127151
410	NC_015915	AAG	2	6	26562	26567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127151
411	NC_015915	GAGTTA	2	12	26574	26585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127151
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413	NC_015915	GTT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127151
414	NC_015915	AT	3	6	26671	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	343127151
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416	NC_015915	ATAG	2	8	26709	26716	50 %	25 %	25 %	0 %	343127151
417	NC_015915	T	6	6	26859	26864	0 %	100 %	0 %	0 %	343127151
418	NC_015915	ATA	2	6	26892	26897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127151

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.